Iniciou nas categorias de base do Corinthians em 2012, pela equipe sub-17;
Em 2013 teve uma breve passagem pelo Flamengo de Guarulhos, onde disputou a Copa São Paulo de Futebol Júnior daquele ano;
Pela base do Corinthians, fez sua estreia no sub-20 em 31 de agosto de 2013, na vitória por 4 a 1 sobre o XV de Piracicaba pelo Paulistão sub-20, entrando aos 29' do segundo tempo;
Conquistou o Campeonato Paulista sub-20 de 2014 e 2015, o Campeonato Brasileiro sub-20 de 2014 e a Copa São Paulo de Futebol Júnior de 2015;
Foi promovido para os profissionais, após saída de Anderson Martins, no início de 2015;
Atuou pelo profissional pela primeira vez em 15 de janeiro de 2015 na derrota por 1 a 0 contra o Colônia, da Alemanha, em jogo válido pela Flórida Cup 2015, competição amistosa;
Logo após, foi emprestado ao Bragantino para disputa da Série B 2015, onde disputou 4 partidas;
Retornou ao Corinthians ainda em 2015 e fez parte do elenco campeão do Campeonato Brasileiro daquele ano;
Fez sua primeira partida oficial pelo Corinthians em 04 de agosto de 2016, na vitória por 2 a 1 diante do Coritiba, pelo brasileirão;
Foram 14 jogos em 2016, sendo 57% de aproveitamento;
Em 25 de fevereiro de 2017, o zagueiro marcou seu primeiro gol com a camisa do Corinthians, na vitória por 3 a 2 pelo campeonato paulista;
Foi Campeão Paulista em 2017 atuando em 5 partidas e um gol, em 07 de maio de 2017;
Em 2017 foi bastante utilizado na equipe titular devido a lesões dos titulares Balbuena e Pablo, e se destacou pelo bom aproveitamento;
Com 22 jogos pelo Campeonato Brasileiro, conquistou seu primeiro título nacional em 15 de novembro de 2017;
Em 2018, marcou seu terceiro gol, novamente pelo Campeonato Paulista, em 02 de abril, na vitória por 1 a 0 do Corinthians sobre o Grêmio Novorizontino;
Conquistou o seu segundo Campeonato Paulista com a camisa alvinegra após atuar em 9 jogos e marcar um gol, em 08 de abril;
Pelo Brasileiro 2018, atuou 12 partidas, além de 2 pela Copa do Brasil e 2 pela Libertadores;
Em 2019, conquistou o tricampeonato paulista com o Corinthians, atuou 5 jogos pela competição, em 21 de abril;
Atuou 3 jogos pelo Campeonato Brasileiro antes de ser emprestado ao Athletico;
Em 29 de junho, o zagueiro foi apresentado oficialmente no Athletico;
Foram 13 partidas pelo Campeonato Brasileiro, sendo 7 vitórias, 3 empates e apenas 3 derrotas;
Na competição, foram apenas 7 gols sofridos em 13 jogos, média de 0,53, a melhor entre os zagueiros do CAP;
Sagrou-se campeão da Taça Suruga, do Japão, na vitória por 4 a 0 sobre o Shonan Bellmare em 07 de agosto;
Encerrou sua passagem pelo clube paranaense com mais uma partida pela Copa do Brasil, onde foi campeão em 18 de setembro, na vitória por 2 a 1 sobre o Inter;
De volta ao Corinthians a pedido do técnico Tiago Nunes, que comandou o Athletico na temporada 2019 , o zagueiro realizou sua primeira coletiva de imprensa em 07 de janeiro de 2020;
Atuou como titular nas duas partidas da Florida Cup;
Zagueiro do paulistão com mais desarmes, 22 totais e 100% de aproveitamento;
Completou 100 jogos pelo Corinthans em 22 de fevereiro;
Somou 103 jogos e 4 gols marcados pelo Corinthians;
Em 20 de julho de 2020 se transferiu em definitivo para o Athletico;
Fez sua reestreia com a camisa do clube em 22 de agosto contra o Fluminense pelo Brasileirão;
Completou 50 jogos pelo Furacão em 14 de fevereiro de 2021;
Foi eleito para a seleção da Série A Sofascore 2020/2021 com média de 7.3;
É o quinto melhor jogador avaliado do elenco na Série A, com média 7.02;
É líder em cortes do Athletico no Brasileirão (3,7/jogo) e na Sul-Americana (4.3);
É o líder em bolas longas certos do time na Sul-Americana (5.8/jogo) e více-líder no Brasileirão (5.7/jogo);
Ajudou o time a chegar à final da Copa Sul-Americana, sendo titular em todos os 12 jogos do Athletico na competição internacional;
Marcou seu primeiro gol com a camisa do Athletico em 20 de outubro, no empate por 2 a 2 contra o Flamengo na semifinal da Copa do Brasil;
Foi fundamental na campanha do Furacão que chegou a final da Copa do Brasil, atuando como titular nos 8 jogos, somando 5 vitórias e 3 empates;
Líder da equipe em cortes no Brasileirão Série A com 74;
Líder da equipe em cortes (52) e lançamentos certos (69) na Sul-Americana;
Em 11/11/2021, marcou seu segundo gol pelo Furacão na vitória rubro-negra por 2 a 1 sobre o Ceará, no Brasileirão;
No dia 20/11/2021 fez o lançamento perfeito para o gol do título que consagrou o Athletico campeão da Copa Sul-Americana;
Completou 100 jogos pelo rubro-negro no empate por 0 a 0 com o São Paulo, pelo Brasileirão, em 24/11/2021;
Disputou a final da Recopa Sul-Americana contra o Palmeiras no início de 2022 e chegou a conceder uma assistência no empate por 2 a 2 do primeiro jogo, em 23/02, mas terminou com o vice-campeonato;
Completou 150 jogos no rubro-negro em 08/10/2022, na partida contra seu ex-clube, Corinthians;
Foi essencial para o Furacão chegar à final da Libertadores após 17 anos, sendo líder do time em diversos quesitos: interceptações (20), cortes (66), passes certos (521), bolas longas (53) e disputas de bola vencidas (83);
Disputou sua primeira decisão de Liberta contra o Flamengo, em 29 de outubro, no Monumental de Guayaquil;
Pelo Brasileirão, terminou no G6 também entre os melhores jogadores do Athletico, líder em: passes certos (846), bolas longas (152), disputas de bola vencidas (137) e cortes (122);
Após mais uma temporada de sucesso, foi eleito melhor zagueiro da Série A pelo prêmio da Gazeta Esportiva, o Troféu Mesa Redonda;
Nos anos de 2023 e 2024, ainda conquistou o Campeonato Paranaense com a equipe do Athletico, encerrando a sua passagem pelo clube como um dos jogadores que mais atuou pelo elenco atual, com 190 jogos e 6 títulos conquistados;
Logo após a disputa do campeonato estadual, o zagueiro foi anunciado como novo reforço do Red Bull Bragantino, em contrato definitivo até dezembro de 2026;
Voltando a equipe em que fez a sua estreia como profissional em jogos oficiais, Pedro Henrique não demorou muito para assumir a titularidade no time do técnico do Pedro Caixinha e já no seu terceiro jogo pelo Massa Bruta, marcou o gol que abriu o placar no empate em 1 a 1 diante do Flamengo, no Nabizão, no dia 04/05/2024.

Títulos
Campeonato Paulista 2017 - Corinthians
Campeonato Brasileiro 2017 - Corinthians
Campeonato Paulista 2018 - Corinthians
Campeonato Paulista 2019 - Corinthians
Levain Cup 2019 - Athletico
Copa Suruga Bank 2019 - Athletico
Copa do Brasil 2019 - Athletico
Copa Sul-Americana 2021- Athletico
Campeonato Paranaense 2023 - Athletico
Campeonato Paranaense 2024 - Athletico

Atualizado em: 07/05/2024