- Natural de Taguatinga (DF) e iniciou sua trajetória no futebol defendendo o Paraná Clube/PR
- No ano de 2012, defendeu as cores do Iguaçu Agex, no Paraná.
- Ainda no Iguaçu Agex, chamou atenção pelo seu futebol e teve seus direitos adquiridos pelo time Estudiantes de La Plata, com apenas 17 anos de idade
- Em 2013, o atleta retornou ao Brasil e começou na base e, posteriormente, no profissional pelo Paraná Clube
Após se destacar na equipe paranaense, o atleta transferiu-se para o Corinthians e depois foi emprestado para clubes como Vasco, Botafogo e Vitória.

Pela equipe Cruzmaltina, em 2017, realizou 50 partidas na temporada.

Já pelo Botafogo, o atleta atuou no ano de 2018 e 2019 e acumulou 37 partidas pela equipe

Anunciado pelo Vitória no dia 23/01/2020, o volante defendeu as cores do Rubro Negro Bahiano por 18 partidas e marcou um gol no período.

Na temporada 2020/21, Jean seguiu para o futebol português e defendeu o Gil Vicente/POR e o Marítimo/POR.

No retorno ao futebol brasileiro, Jean Irmer vestiu a camisa do Juventude.

Pela equipe gaúcha, Jean foi peça importante no acesso do clube à primeira divisão nacional na temporada 2023.

Na temporada 2023, Jean Irmer disputou 35 jogos pelo Juventude.

O meio-campista marcou cinco gols no ano e contribuiu ainda com uma assistência para o time da Serra Gaúcha.

Na Série B do Campeonato Brasileiro, Jean participou de 25 jogos, sendo 22 deles como titular da equipe. No torneio, marcou dois gols.